Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg12Q9CQY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms