Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim8Q9CQQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms