Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM7

Lce3b, Late cornified envelope 3B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3bQ9CQM7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Lce3bQ9CQM7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lce3bQ9CQM7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms