Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI4

Nwc, Uncharacterized protein C11orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NwcQ9CQI4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NwcQ9CQI4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NwcQ9CQI4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NwcQ9CQI4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NwcQ9CQI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NwcQ9CQI4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms