Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms