Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQ90 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQ90 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQ90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms