Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700129C05RikQ9CQ77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700129C05RikQ9CQ77 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms