Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkp2Q9CQ73 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkp2Q9CQ73 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms