Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Efcab2Q9CQ46 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcab2Q9CQ46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms