Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl49Q9CQ40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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