Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2a1Q99PM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms