Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn6Q99PL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn6Q99PL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn6Q99PL6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn6Q99PL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn6Q99PL6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms