Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg5Q99PE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg5Q99PE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcg5Q99PE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms