Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GpnmbQ99P91 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms