Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem2Q99NH8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms