Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsmfQ99NF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms