Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rims1Q99NE5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rims1Q99NE5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rims1Q99NE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms