Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b1Q99NB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b1Q99NB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b1Q99NB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms