Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brms1Q99N20 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brms1Q99N20 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms