Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac9Q99N13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac9Q99N13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms