Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcbQ99MP3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CalcbQ99MP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms