Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme5Q99MH5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme5Q99MH5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme5Q99MH5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms