Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q99KU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q99KU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q99KU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q99KU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q99KU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q99KU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q99KU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q99KU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q99KU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q99KU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q99KU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q99KU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q99KU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q99KU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q99KU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q99KU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q99KU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q99KU6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q99KU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q99KU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q99KU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q99KU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q99KU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q99KU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q99KU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q99KU6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q99KU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q99KU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q99KU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q99KU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q99KU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q99KU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q99KU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q99KU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q99KU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms