Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vmp1Q99KU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmp1Q99KU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms