Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps4Q99KG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hps4Q99KG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps4Q99KG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms