Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nlgn1Q99K10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlgn1Q99K10 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms