Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms