Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lims1Q99JW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lims1Q99JW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms