Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx58Q99J87 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx58Q99J87 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dhx58Q99J87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx58Q99J87 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms