Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Def8Q99J78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Def8Q99J78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Def8Q99J78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms