Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Apobec3Q99J72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apobec3Q99J72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms