Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GhdcQ99J23 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GhdcQ99J23 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms