Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1l1Q923U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1l1Q923U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tom1l1Q923U0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1l1Q923U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms