Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim59Q922Y2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim59Q922Y2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms