Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HlcsQ920N2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HlcsQ920N2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms