Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc1bQ920F6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smc1bQ920F6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms