Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med28Q920D3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms