Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6cQ91ZQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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