Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsqQ91ZF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsqQ91ZF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms