Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg13Q91YI1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg13Q91YI1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms