Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Trpm2Q91YD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Trpm2Q91YD4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms