Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha2Q91Y17 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha2Q91Y17 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha2Q91Y17 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms