Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb12Q91Y07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb12Q91Y07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms