Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lnx2Q91XL2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx2Q91XL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx2Q91XL2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms