Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csde1Q91W50 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms