Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Klc3Q91W40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Klc3Q91W40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms