Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam3cQ91VU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam3cQ91VU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms