Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Farp2Q91VS8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Farp2Q91VS8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Farp2Q91VS8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Farp2Q91VS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms