Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col26a1Q91VF6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col26a1Q91VF6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col26a1Q91VF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col26a1Q91VF6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col26a1Q91VF6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col26a1Q91VF6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms