Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms